Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms