Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms