Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRNDQ9UKY0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms