Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEFF2Q9UIK5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEFF2Q9UIK5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms