Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SCN11AQ9UI33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCN11AQ9UI33 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms