Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Plod3Q9R0E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms