Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trpc3Q9QZC1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc3Q9QZC1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms