Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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