Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC4BQ9NT99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC4BQ9NT99 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC4BQ9NT99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms