Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bco1Q9JJS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bco1Q9JJS6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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