Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OtofQ9ESF1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
OtofQ9ESF1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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