Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc46a3Q9DC26 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms