Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ergic1Q9DC16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ergic1Q9DC16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms