Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms