Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spns3Q9D232 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms