Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znhit3Q9CQK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znhit3Q9CQK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms