Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NKX6-2Q9C056 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms