Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GORASP1Q9BQQ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GORASP1Q9BQQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GORASP1Q9BQQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms