Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim3Q99PE5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim3Q99PE5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms