Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf17Q99MV7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rnf17Q99MV7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf17Q99MV7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms