Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOQ99835 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOQ99835 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOQ99835 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOQ99835 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOQ99835 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOQ99835 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOQ99835 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOQ99835 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms