Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E2Q96LR5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E2Q96LR5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms