Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg8Q8VE18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smg8Q8VE18 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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