Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrdQ8K2M3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrrdQ8K2M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms