Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrit1Q8K099 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrit1Q8K099 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrit1Q8K099 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms