Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP13Q86W25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP13Q86W25 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms