Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC23A3Q6PIS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC23A3Q6PIS1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310 ms