Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med16Q6PGF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med16Q6PGF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms