Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2surpQ6NV83 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2surpQ6NV83 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms