Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg9aQ68FE2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9aQ68FE2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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