Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Knl1Q66JQ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Knl1Q66JQ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Knl1Q66JQ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Knl1Q66JQ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Knl1Q66JQ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Knl1Q66JQ7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms