Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3c2aQ61194 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3c2aQ61194 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pik3c2aQ61194 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms