Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC181Q5TID7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC181Q5TID7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms