Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trappc1Q5NCF2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Trappc1Q5NCF2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trappc1Q5NCF2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trappc1Q5NCF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trappc1Q5NCF2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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