Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C87499Q3UX49 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C87499Q3UX49 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms