Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Srsf6Q3TWW8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms