Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TchpQ3TVW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TchpQ3TVW5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms