Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trim71Q1PSW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim71Q1PSW8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim71Q1PSW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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