Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIGQ13278 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIGQ13278 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIGQ13278 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIGQ13278 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIGQ13278 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RIGQ13278 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RIGQ13278 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RIGQ13278 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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