Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah2Q06986 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms