Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha4Q03137 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha4Q03137 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms