Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Psme1P97371 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psme1P97371 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Psme1P97371 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Psme1P97371 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms