Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IP78347 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IP78347 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms