Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH6P55285 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH6P55285 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH6P55285 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH6P55285 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH6P55285 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH6P55285 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH6P55285 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH6P55285 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH6P55285 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH6P55285 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH6P55285 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH6P55285 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH6P55285 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms