Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CratP47934 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CratP47934 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CratP47934 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CratP47934 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CratP47934 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CratP47934 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CratP47934 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms