Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
InaP46660 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
InaP46660 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
InaP46660 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
InaP46660 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
InaP46660 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
InaP46660 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
InaP46660 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
InaP46660 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
InaP46660 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
InaP46660 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms