Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd27P41272 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd27P41272 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd27P41272 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd27P41272 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd27P41272 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd27P41272 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd27P41272 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd27P41272 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd27P41272 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd27P41272 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cd27P41272 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms