Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TfamP40630 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TfamP40630 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TfamP40630 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TfamP40630 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TfamP40630 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TfamP40630 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TfamP40630 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TfamP40630 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TfamP40630 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TfamP40630 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms