Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rom1P32958 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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