Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC5P28715 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms